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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
26/12/2019 |
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Data da última atualização: |
13/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BLECHA, I. M. Z.; SOUSA, I. I.; FERREIRA, A. B. R.; FEIJO, G. L. D.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SIQUEIRA, F. |
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Afiliação: |
Isabella Maiumi Zaidan Blecha, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul - UFMS/Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Programa de Pós-Graduação em Ciência Animal; Isadora Inácio Sousa, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul - UFMS/Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Programa de Pós-Graduação em Ciência Animal; ANNA BEATRIZ ROBOTTOM FERREIRA, CTAA; GELSON LUIS DIAS FEIJO, CNPGC; ROBERTO AUGUSTO DE A TORRES JUNIOR, CNPGC; FABIANE SIQUEIRA, CNPGC. |
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Título: |
Alternative methodologies for genotyping polymorphisms in the CAST and CAPN1 genes in beef cattle. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Zootecnia, v. 48, e20180218, 2019. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The objectives of this study were to genotype single nucleotide polymorphisms (SNP) AF159246:g.2959A>G (CAST/DdeI) and AF248054.2:g.6545C>T (CAPN4751) in beef cattle by PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism), using the restriction enzyme DdeI for both SNP, and describe the use of these genotyping methodologies for the first time. For the SNP located in the CAST gene, new primers were designed, and for the SNP of the CAPN1 gene, the same primers previously described in the literature were used. Bonsmara, Caracu, Senepol, Nelore, and Angus bulls were chosen from among the most used bulls in breeding programs according to their genealogy and the lowest possible degree of parentage between them to ensure an experimental sample representative of the genetic variability in each breed. For the CAST and CAPN1 genes, respectively, the following number of animals were analyzed: Bonsmara (n = 25/22), Caracu (n = 25/26), Senepol (n = 25/24), Nelore (n = 26/26), and Angus (n = 25/24). The accuracy of these methodologies was confirmed by direct sequencing of PCR products generated for the two polymorphisms. The new primers developed for CAST/DdeI SNP detection and the use of DdeI enzyme for CAPN4751 SNP detection were effective in genotyping, since no inconclusive genotypes were observed for these genes. Thus, the genotyping of beef cattle using the PCR-RFLP technique for CAST and CAPN1 genes is robust, relatively inexpensive, and easy to perform in any basic molecular biology laboratory. If the association of these markers with traits of economic interest in beef cattle is confirmed in new studies, these methodologies may contribute to the selection of animals with superior genetics, i.e., with the potential to produce better-quality meat, either by marker-assisted selection or by the inclusion of these polymorphisms in high-density marker panels. MenosThe objectives of this study were to genotype single nucleotide polymorphisms (SNP) AF159246:g.2959A>G (CAST/DdeI) and AF248054.2:g.6545C>T (CAPN4751) in beef cattle by PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism), using the restriction enzyme DdeI for both SNP, and describe the use of these genotyping methodologies for the first time. For the SNP located in the CAST gene, new primers were designed, and for the SNP of the CAPN1 gene, the same primers previously described in the literature were used. Bonsmara, Caracu, Senepol, Nelore, and Angus bulls were chosen from among the most used bulls in breeding programs according to their genealogy and the lowest possible degree of parentage between them to ensure an experimental sample representative of the genetic variability in each breed. For the CAST and CAPN1 genes, respectively, the following number of animals were analyzed: Bonsmara (n = 25/22), Caracu (n = 25/26), Senepol (n = 25/24), Nelore (n = 26/26), and Angus (n = 25/24). The accuracy of these methodologies was confirmed by direct sequencing of PCR products generated for the two polymorphisms. The new primers developed for CAST/DdeI SNP detection and the use of DdeI enzyme for CAPN4751 SNP detection were effective in genotyping, since no inconclusive genotypes were observed for these genes. Thus, the genotyping of beef cattle using the PCR-RFLP technique for CAST and CAPN1 genes is robust, relatively inexpensive, and easy to perform i... Mostrar Tudo |
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Thesaurus Nal: |
Animal breeding; Marker-assisted selection; Meat tenderness. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/207815/1/Alternative-methodologies-for-genotyping.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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| Registros recuperados : 88 | |
| 1. |  | ARRUDA, R. P. de; CELEGHINI, E. C. C.; GARCIA, A. R.; SANTOS, G. de C. dos; LEITE, T. G.; OLIVEIRA, L. Z.; LANÇONI, R.; RODRIGUES, M. de P. Morfologia espermática de touros: interpretação e impacto na fertilidade. Revista Brasileira de Reprodução Animal, Belo Horizonte, v. 39, n. 1, p. 47-60, jan./mar. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 2. | | AFONSO, T. M.; CARVALHO, G. M. C.; HADLICH, J. C.; RODRIGUES, V. de S.; BARROS, D. A.; VASCONCELOS, A. B. de; IGARASI, M. S. Use of crosses for sustainability in livestock farming in the Brazilian Meio-Norte region. Revista Brasileira de Zootecnia, v. 49, e20190228, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 3. | | RAMOS, R. A. do N.; RAMOS, C. A. do N.; JUSI, M. M. G.; ARAUJO, F. R.; MACHADO, R. Z.; FAUSTINO, M. A. da G.; ALVES, L. C. Polymerase chain reaction and real-time PCR for diagnosing of Leishmania infantum chagasi in dogs. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, v. 21, n. 3, p. 192-195, jul.-set. 2012| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 4. | | PELLEGRIN, A. O.; MARTINS, N. E.; LAGE, A. P.; COSTA, G. M. da; GOMES, L. I.; REINATO, A. P. R.; LEITE, R. C. Tricomonose bovina no Estado de Minas Gerais: ocorrencia e tratamento. Revista Brasileira de Medicina Veterinaria, Rio de Janeiro, v.20, n.6, p.244-248, nov./dez., 1998.| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 5. | | LEITE, R. C.; PELLEGRIN, A. O.; MARTINS, N. E.; SILVA, N.; GOMES, L. I.; COSTA, G. M.; REINATO, A. P. R.; GUIMARAES, P. H. S.; LAGE, A. P. Tricomonose bovina: diagnostico realizados na Escola de Veterinaria da UFMG no periodo de 1979 a 1995. Revista Brasileira de Reproducao Animal, v.21, n.2, p.166-168, 1997. Anais do 12 Congresso Brasileiro de Reproducao Animal.| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 6. | | ZIMMERMANN, N. P.; AGUIRRE, A. de A. R.; RODRIGUES, V. da S.; GARCIA, M. V.; MEDEIROS, J. F.; BLECHA, I. M. Z.; DUARTE, P. O.; CRUZ, B. C.; CUNHA, R. C.; MARTINS, T. F.; ANDREOTTI, R. Wildlife species, Ixodid fauna and new host records for ticks in an Amazon forest area, Rondônia, Brazil. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, Jaboticabal, v. 27, n. 2, p. 177-182, apr.-june 2018 Título em português: Espécies de vida selvagem, fauna ixodídica e novos registros de hospedeiros de carrapatos em uma área de Floresta Amazônica, Rondônia, Brasil.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 7. | | TEMBUE, A. A. M.; SILVA, J. B. da; SILVA, F. J. M. da; PIRES, M. S.; BADANI, C. D.; SOARES, C. O.; MASSARD, C. L.; FONSECA, A. H. da. Seroprevalence of IgG antibodies against Anaplasma marginale in cattle from south Mozambique Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, v. 20, n. 4, p. 318-324, out-dez. 2011. 20| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 10. | | RESENDE, L. H. G. da S. de; ALBERTINI, T. Z.; DETMANN, E.; TOMICH, T. R.; FRANCO, G. L.; LEMPP, B.; MORAIS, M. da G. Consumo e digestibilidade do feno de capim-braquiária em bovinos de corte sob suplementação com mistura contendo sulfato de amônio, caseína e uréia. Revista Brasileira de Zootecnia, v.37, n.4, p. 717-723, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - C |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 11. | | NASCIMENTO, T. V. C.; MIRANDA, M. de S.; BARROS, C. H. S. C.; SOUZA, T. T. dos S.; LOPES JÚNIOR, E. S.; VOLTOLINI, T. V.; MORAES, S. A. de; NOGUEIRA, D. M.; CORDEIRO, M. F. Return of postpartum ovarian activity in dairy goats supplemented with different levels of energy. Revista Brasileira de Saúde Produção Animal, Salvador, v. 15, n. 4, p. 1061-1071, out./dez., 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 12. | | LAGE, A. P.; PELLEGRIN, A. O.; COSTA, G. M.; SILVA, N.; REINATO, A. P. R.; GOMES, L. I.; GUIMARAES, P. H. S.; LEITE, R. C. Campilobacteriose genital bovina: diagnostico na Escola de Veterinaria da UFMG de 1976 a 1996. Revista Brasileira de Reproducao Animal, v.21, n.2, p.164-166, 1997. Anais do 12 Congresso Brasileirto de Reproducao Animal.| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 13. | | PAIXÃO, J. L. F.; PRATA, M. C. de A.; FURLONG, J.; TASSINARI, W. S.; Bittencourt, V. R. E. P.; ANGELO, I. C. Ganho de peso em bovinos leiteiros: comparação entre parasiticida químico convencional, fitoterápicos e homeopatia, no controle de R. microplus. Revista de Educação Continuada em Medicina Veterinária e Zootecnia do CRMV-SP, v. 16, n. 2, p. 83-84, 2018. Edição dos anais do 8º Congresso de Homeopatia Veterinária da Associação Médico Veterinária Homeopática Brasileira, Londrina, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 14. | | TAMEIRÃO, E. R.; FARIA, P. H. A. de; GONZAGA, L. W. F.; ALMEIDA, J. V. F. C. de; SOUSA, T. M.; BRANDAO, H. de M.; FERRANTE, M. Modelagem farmacocinética/farmacodinâmica do florfenicol para o tratamento da adenite equina por meio da simulação de Monte Carlo. Revista Brasileira de Ciência Veterinária, v. 28, n. 2, p. 75-80, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
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| 16. | | GARCIA, M. V.; SILVA, D. C. da; ALMEIDA, R. F. C. de; CUNHA, R. C.; MATIAS, J.; BARROS, J. C.; ANDREOTTI, R.; SZABÓ, M. P. J. Environmentally associated ticks (Acari: Ixodidae) in Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Brazil. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, Jaboticabal, v. 22, n. 1, p. 1-5, jan.-mar. 2013| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 20. | | CHAGAS, A. C. de S.; OLIVEIRA, M. C. de S.; ESTEVES, S. N.; OLIVEIRA, H. N. DE; GIGLIOTI, R.; GIGLIOTI, C.; CARVALHO, C. DE O.; FERREZINI, J.; SCHIAVONE, D. C. Parasitismo por nematóides gastrintestinais em matrizes e cordeiros criados em São Carlos, São Paulo. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, v. 17, Supl. 1, p. 126-132, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 1. | | 0901556, ARQUIVOS FLUMINENSES DE MEDICINA VETERINARIA, Editora Cientifica Nacional Ltda., Rio De Janeiro, RJ
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| 2. | | 0900052, REVISTA BRASILEIRA DE CIENCIA VETERINARIA, Universidade Federal Fluminense. Faculdade de Veterinaria, Niteroi-RJ
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Pantanal; Embrapa Rondônia; Embrapa Suínos e Aves. | |
| 3. | | 0900906, REVISTA DA FACULDADE DE MEDICINA VETERINARIA E ZOOTECNIA DA USP, USP.Faculdade de Medicina Veterinaria e Zootecnia, Sao Paulo-SP
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| 4. | | 0901341, REVISTA DO INSTITUTO ADOLFO LUTZ, Instituto Adolfo Lutz, Sao Paulo-SP
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| 5. | | 0901003, REVISTA BRASILEIRA DE MEDICINA VETERINARIA, Sociedade Brasileira de Medicina Veterinaria, Rio de Janeiro-RJ
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